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HO-1基因启动子微卫星多态性与COPD易感性的研究

时间:2022-12-13 08:20:03 来源:网友投稿

摘要:目的:探讨HO-1启动子微卫星多态性与COPD易感性的关系。方法:应用PCR技术结合聚丙烯酰胺凝胶电泳及硝酸银染色,根据年龄组及吸烟史对57例COPD患者和44例非COPD人群血红素加氧酶-1(HO-1)启动子微卫星多态性进行分析。结果:COPD组HO-1基因启动子(GT)n大量重复序列(n>30)(L型等位基因)的频率(0.2105)显著高于对照组(0.0909)(P<0.05)而(GT)n小量重复序列(n<25)(S型等位基因)的频率(0.3158)显著低于对照组(0.4545)(P<0.05)。不同年龄组以及在吸烟指数<31PY时,两组人群HO-1启动子微卫星多态性分布未发现显著性差异(P>0.05),但当吸烟指数≥31PY时,COPD组L型等位基因频率显著高于对照组(P<0.05)。结论:①HO-1启动子(GT)n大量重复序列可能与大量吸烟人群的COPD易感性有关,可能在一定程度上参与了COPD的发病机制。②HO-1基因启动子微卫星多态性可作为一种遗传标记用于早期发现对COPD易感的高风险吸烟人群,对于预防COPD的发展具有重要意义。

关键词:HO-1基因;微卫星多态性;COPD;易感性

中图分类号:R816.41 文献标识码:A 文章编号:(2007)01-0097-05

慢性阻塞性肺病(COPD)是一常见的呼吸系统疾病,包括慢性阻塞性支气管炎和慢性阻塞性肺气肿,其气流受限呈慢性进行性。吸烟是COPD发展过程中最危险的因素,然而,仅10-20%的长期吸烟者最终发展成为症状性COPD,表明COPD的发生发展可能存在着遗传易感性。氧化/抗氧化失衡是COPD发病机制之一,如香烟烟雾中过多的氧化剂和自由基直接促进肺组织细胞损害,可能是COPD发病过程的主要启始因子。血红素加氧酶-1(HO-1)是血红素加氧酶(HO)的可诱导性同工酶,研究发现H0-1不仅受底物血红素诱导,许多非血红素物质,如香烟烟雾中的毒性物质(自由基、重金属及氧化剂等)、内毒素及炎症细胞因子等也可诱导其表达,这种诱导作用在防御血红素及非血红素氧化损伤中,在维持细胞内环境稳定方面起重要作用,因此HO-1的不同诱导表达水平可能与一些氧化应激性疾病的发病相关。近年来研究发现HO-1基因启动子5’端区域(GT)n重复序列具有高度多态性,在热应激状态下(GT)n重复序列对HO-1的基因转录可能产生不同的调节作用。由于HO-1基因启动子5’端区域(GT)n不同重复序列影响了氧化应激对HO-1基因表达的诱导,从而影响了HO-1的抗氧化应激作用而可能与COPD的发病相关。据此,我们利用PCR技术分析了COPD的吸烟人群和和非COPD的吸烟人群其HO-1基因启动子(GT)n重复序列等位基因不同的频率分布,以探讨HO-1基因启动子微卫星多态性与COPD发生发展的相关性。

一、材料与方法

1.人群选择

符合中华医学会呼吸病学分会COPD诊治规范标准(草案)的COPD稳定期病人57例。年龄37~86岁,平均年龄58.96±13.44岁。男性49例,女性8例。一秒钟用力呼气容积占预计值百分比(FEV1占预计值%)平均为(46±15)%;一秒率用力呼气容积,用力肺活量(FEV1/FVC)平均为(52±5)%。所有患者无呼吸系变态反应病史,皮肤过敏原实验阴性,且无癌症,胶原血管疾病,先天性心脏病等严重疾患。对照组为非COPD人群44人,男性31例,女性13例。年龄20~80岁,平均年龄41.18±16.05岁。对照组人群均无慢性呼吸系疾病史,肺功能检查各项指标均正常。COPD组无吸烟史者17人,有吸烟史者40人。对照组无吸烟史者18人,有吸烟史者26人。吸烟指数以PY计算[1PY=1盒香烟(20支),天×1年]。应用一次性定量真空采血管(武汉致远医疗科技有限公司产品)分别采集病人及对照组外周静脉血5ml,置-800C保存备用。

2.试剂

Taq酶、PCR缓冲液、dNTP、丙烯酰胺及亚甲双丙烯酰胺均为上海Sangon生物工程公司产品。DNA分子量标记pBR322 DNA/HaeⅢ为华美生物工程公司产品。

3.方法

(1)模板DNA的制备常规蛋白酶K消化,酚/氯仿外周血白细胞中提取基因组DNA。

(2)HO-1基因启动子5’端poly(GT)n区域扩增。

引物设计参照文献(由上海Sangon生物工程公司合成):上游:5’-AGAGCCTGCAGCTYCTCAGA-3’;下游:5’-ACAAAGTCTGGCCATAGGAC-3’,扩增片段大小为67bp+(GT)n。

PCR反应体积为100gl,含10×PCR缓冲液10μl(50mmol/L KCl,10mmol/L Tirs-HCl,15mmol/LMgCl2),dNTP 200μmol/L,每条引物30pmol,50ngDNA,2单位的Taq DNA聚合酶。PCR反应程序为94℃初始变性5分钟后进行29次循环:95℃30秒,55℃30秒,72℃1.5分钟,随后72℃延伸5分钟。

(3)电泳和银染

取PCR产物10μl上样于10%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳上。电压60V,时间5-6小时。电泳后,将凝胶置于含10%乙醇与0.5%冰乙酸的固定液,固定10分钟,然后用双蒸水洗涤两次,每次5分钟;将其放入银染液(0.15%AgN03)染色10分钟,然后用用双蒸水洗涤三次,每次20秒;放入0.5%NaOH及15%甲醛的显色液中显影至可见清晰条带为止,约10-20分钟;再将胶放入终止液(10%冰乙酸)以终止反应,持续10分钟;最后将胶置入脱水液(20%乙醇)脱水10分钟,吸取水分,室温下晾干,扫描后拍照。

(4)标准曲线的拟合及DNA片段长度的估计

测量已知DNA分子量标记的迁移率作为自变量(X),其长度(bp)为因变量拟合标准曲线。测量加样孔前沿至DNA条带间的距离,代入标准曲线,求得待测DNA片段长度。根据文献计算(GT)n重复拷贝数n=(扩增的DNA片段长度-67)/2。

(5)杂合度(HET)及多态信息容量(polymorphisminformation content,PIC)计算采用文献计算公式分别为:

式中n为该位点的等位基因数;Pi为第i个等位基因的频率。

(6)统计学处理

采用x2检验进行Hardy-Weinberg平衡(HWE)检验及将每一基因型吻合度度X2值相加,计算公式:x2=∑(期望值一观察值)2/期望值。采用Woof公式

计算相对风险率(relative risk,RR)。两组人群HO-1微卫星多态位点基因频率及基因型频率的构成比用x2检验进行比较。

二、结果

1.标准曲线的拟合

应用SPSS10.0软件非线型回归模型显示最适模型为三次曲线模型:Y=bo+b1x+b2+b3X3(Y为分子量;x为迁移率)。根据每次电泳结果共拟合12个三次曲线方程,F值为604.51-911.61,相关系数R2值为0.986~0.998,P值均<0.001。

2.HO-1基因启动子(GT)n重复序列的多态分布及其与COPD的关系

(1)两组人群HO-1基因启动子(GT)n重复序列的多态分布特征及比较

PCR产物的聚丙烯酰胺凝胶电泳图见图1。HO-1基因启动子(GT)重复序列数目(n)呈高度多态性,其数值范围为16~38,PIC为0.889。频率(0.2525)最高的是n=27,其次为22(0.1238)和30(0.0693)。对照组PIC及HET分别为0.887、0.892,COPD组PIC及HET分别为0.878、0.885(见表1)。参考文献根据n值的不同分为三组人群,n<25为小量重复序列(S等位基因);25-29为中量重复序列(M等位基因);≥30为大量重复序列(L等位基因)。COPD组与对照组HO-1基因微卫星多态位点等位基因及基因型分布(见表1与表2)。两组基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.75,P>0.5),提示所计算的两组基因型频率与预期基因型频率基本一致,具有群体代表性。COPD组中含有L等位基因的基因型(L/L、L/M、L/S,I组)频率显著高于对照组,而非L等位基因的基因型(Ⅱ组)频率显著低于对照组(P<0.01)。两组间各等位基因频率分布有显著性差异(X2=6.93,P<0.05),S型与M型基因频率无显著性差异(X2=1.7133,P>0.1),COPD组L型基因频率显著高于对照组(X2=6.33,P<0.01)而其S型频率显著低于对照组(X2=4.074,P<0.05)(见表1)。L型等位基因对(s+M)等位基因的RR为2.67(95%CI 1.13-6.27)(X2=5.0555,p<0.025),而s对(L+M)等位基因的RR为0.55(95%CI 0.31-0.99)(P<0.05)(见表3)

注:1.检验自由度(df)为:df=基因型数目—等位基因数。

2.HWEx2检验中 x2=∑(期望值-观察值)2/期望值,其中A/A基因型期望值=(A等位基因型频率)2×n,A/G基因型期望值=(2×A等位基因型频率×G等位基因型频率)×n,G/G基因型期望值=(G等位基因型频率)2×n。

S:(L+M)

(2)两组人群中不同年龄组、不同吸烟史与HO-1(GT)n重复序列多态分布的关系

本研究发现在不同年龄组中COPD组L型等位基因的频率似乎高于对照组,但无统计学意义(P值均>0.05)。在吸烟指数<31PY时COPD组L型等位基因的频率均高于对照组但未发现统计学意义(P值均>0.05)。当吸烟指数(PY)≥31PY时,COPD组L型等位基因的频率显著高于对照组(P<0.05),L型等位基因对其他基因型的RR为13.8(95%CI4.66~40.85)(见表4)。

M:分子量标记1:HO-1 S/S基因型;2:HO-1M/S基因型;3:HO-1M/M基因型;4:HO-1 L/M基因型;5:HO-1 M/M基因型;6:HO-1M/M基因型;7:HO-1M/S基因型。

三、讨论

COPD发病机制的主要病理过程是肺部炎症,氧化/抗氧化失衡及蛋白酶/抗蛋白酶失衡。肺部氧化负荷增加的原因主要为香烟中的氧化剂和自由基。HO-1防御氧化应激的机制可能在于以下几个方面。HO-1在氧化分解血红素的反应中所释放的铁有助于诱导铁蛋白的合成,活性氧(ROS)(超氧化物和H2、O2等)的毒性作用取决于铁的出现。细胞内游离铁池与超氧化物和H2、O2反应产生毒性的羟自由基(Fenton反应),由于HO-1催化血红素释放的游离铁能诱导铁蛋白合成,因此作为一种铁储存库的形式限制铁参与Fenton反应。胆红素作为血红素分解的代谢产物其本身就是一种强抗氧化剂。体外研究发现胆红素能有效的清除过氧化氢自由基。Stocker等进一步研究发现人正常血浆浓度的胆红素可防止白蛋白氧化。HO-1所产生的CO与核转录因子-kB(NF-KB)共同作用能防御肿瘤坏死因子-a(TNF-a)介导的血管内皮细胞的凋亡。上述结果提示HO-1的不同诱导表达水平可能与COPD的发生发展相关。HO-1基因5’端区域(GT)n重复序列位于热休克元件和顺式调节元件之间,其中一些特殊形式的等位基因可能影响HO-1基因的转录,可以推测HO-1基因5’端区域(GT)n重复序列的长度可能与COPD的发病机制相关。

我们的结果显示,两组人群中HO-1启动子不同(GT)n重复序列的6种等位基因的频率符合ardy-Weinberg平衡遗传定律,表明具有群体代表性。对照组PIC及HET分别为0.887、0.892,COPD组PIC及HET分别为0.878、0.885,提示:HO-1基因启动子微卫星多态性具有丰富的多态信息量,可作为遗传多态标记研究该基因与COPD易感性的关系。在两组人群中发现,COPD组L型基因频率显著高于对照组而其S型频率显著低于对照组,L型等位基因对(S+M)等位基因的RR为2.67,而S对(L+M)等位基因的RR为0.55,提示L型等位基因的个体与非L型的个体相比,患COPD的风险性增加了1.67倍,而S组的个体与非S型的个体相比较,患COPD的风险性降低了0.45倍。根据不同年龄、不同吸烟史进行分析发现,当吸烟指数≥31PY时,COPD患者HO-1基因启动子(GT)n大量重复序列的频率显著高于对照组,提示大量长期吸烟者且具有L型等位基因的个体与其他个体比较对COPD的易感性增加了。我们的结果与Yamada等在日本吸烟人群中的肺气肿患者中研究HO-1基因启动子微卫星多态性与肺气肿的易感性的结果相似,他们的结果表明HO-1基因启动(GT)n大量重复序列可能降低吸烟过程中产生的ROS对HO-1基因的诱导因而导致肺气肿的发生。

总之,HO-1基因启动子微卫星多态性可作为一种遗传标记用于早期发现对COPD易感的高风险吸烟人群,对于预防COPD的发展具有重要意义。但HO-1基因启动子微卫星多态性与COPD的易感性的研究还处在初级阶段,该多态性与COPD的易感性在不同种族可能有所差异。有关HO-1基因启动子微卫星多态性与COPD的易感性的在不同种族的大样本研究及其机制需要进一步探讨。此外,COPD的发生发展与多种基因的易感性相关,当多种基因共同发挥作用时,单个基因的影响相对减弱,显然单一基因型不能解释COPD发病中全部的基因调控机制及其遗传易感性。今后的工作将集中在多个基因的多态性与COPD易感性的关系上,以寻找出预防COPD发生发展的多种基因标志。

收稿日期:2006-09-25

作者简介:马志明(1961- ),男,河南柘城人,医学博士,广州市胸科医院呼吸内科副主任医师。通讯作者:韩泽民(1966- ),男,河南柘城人,医学博士,副教授,中国人民武装警察部队医学院附属医院副主任医师,研究方向为颅颔面部整形与种植修复。

基金项目:“十五”国家科技攻关计划项目[编号2001BA703803(B);卫生部部属临床学科重点项目(学科代码3202060)

[责任编辑 沈 勇]

注:本文中所涉及到的图表、注解、公式等内容请以PDF格式阅读原文。

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